Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
P04213 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
P04213 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P04213 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
P04213 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
P04213 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
P04213 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
P04213 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
P04213 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
P04213 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
P04213 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
P04213 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
P04213 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
P04213 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
P04213 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
P04213 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
P04213 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P04213 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P04213 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P04213 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
P04213 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
P04213 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
P04213 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
P04213 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P04213 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P04213 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
P04213 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
P04213 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
P04213 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P04213 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P04213 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
P04213 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P04213 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P04213 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
P04213 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
P04213 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P04213 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
P04213 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
P04213 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
P04213 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P04213 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P04213 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P04213 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
P04213 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms