Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04212 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04212 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04212 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04212 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P04212 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P04212 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04212 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04212 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04212 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04212 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04212 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04212 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04212 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04212 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P04212 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04212 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04212 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04212 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04212 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04212 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04212 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P04212 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P04212 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P04212 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P04212 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P04212 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
P04212 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P04212 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P04212 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04212 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04212 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P04212 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms