Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col4a1P02463 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col4a1P02463 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a1P02463 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms