Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01915 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01915 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01915 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01915 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01915 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01915 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01915 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01915 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01915 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01915 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01915 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01915 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01915 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01915 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01915 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01915 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01915 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01915 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01915 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01915 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01915 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01915 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01915 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01915 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01915 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01915 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01915 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01915 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01915 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01915 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01915 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01915 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01915 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01915 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01915 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01915 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01915 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01915 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01915 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01915 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.5 ms