Protein–RNA interactions for Protein: P01806

Ig heavy chain V region 441, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01806 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01806 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01806 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01806 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01806 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01806 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01806 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01806 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01806 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01806 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01806 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01806 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01806 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01806 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01806 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01806 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01806 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01806 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01806 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01806 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01806 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01806 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01806 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01806 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01806 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01806 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01806 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01806 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01806 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01806 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01806 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01806 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01806 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01806 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms