Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01790 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01790 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01790 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01790 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01790 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01790 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01790 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01790 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01790 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01790 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01790 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01790 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01790 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01790 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01790 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01790 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01790 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01790 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01790 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01790 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01790 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01790 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms