Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01789 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01789 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01789 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01789 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01789 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01789 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01789 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01789 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01789 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01789 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01789 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01789 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01789 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01789 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01789 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01789 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01789 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01789 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01789 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01789 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01789 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01789 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01789 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01789 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01789 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01789 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01789 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01789 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01789 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01789 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01789 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01789 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01789 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01789 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01789 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01789 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01789 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01789 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01789 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01789 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01789 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms