Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01680 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01680 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01680 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01680 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01680 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01680 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01680 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01680 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01680 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01680 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01680 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01680 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01680 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01680 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01680 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01680 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01680 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01680 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01680 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01680 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01680 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01680 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01680 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01680 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01680 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01680 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01680 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01680 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01680 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01680 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01680 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01680 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01680 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01680 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01680 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01680 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01680 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01680 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01680 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01680 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01680 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01680 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01680 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01680 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01680 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01680 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01680 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01680 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01680 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01680 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms