Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01638 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01638 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01638 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01638 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01638 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01638 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01638 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01638 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01638 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01638 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01638 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01638 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01638 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01638 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01638 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01638 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01638 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01638 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01638 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01638 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01638 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01638 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01638 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01638 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01638 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01638 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01638 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01638 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01638 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01638 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01638 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01638 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01638 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01638 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01638 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01638 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01638 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01638 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01638 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01638 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01638 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01638 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01638 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01638 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01638 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01638 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01638 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01638 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01638 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01638 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01638 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01638 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01638 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01638 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01638 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01638 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01638 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01638 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01638 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01638 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01638 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms