Protein–RNA interactions for Protein: P01634

Ig kappa chain V-V region MOPC 21, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01634 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01634 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01634 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01634 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01634 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01634 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01634 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01634 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01634 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01634 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01634 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01634 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01634 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01634 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01634 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01634 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01634 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01634 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01634 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01634 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01634 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01634 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01634 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01634 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01634 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01634 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01634 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01634 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01634 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01634 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01634 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01634 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01634 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01634 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01634 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01634 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01634 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01634 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01634 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01634 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01634 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01634 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01634 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01634 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01634 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01634 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01634 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01634 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01634 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01634 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P01634 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01634 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01634 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01634 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01634 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01634 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01634 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01634 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01634 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01634 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01634 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01634 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms