Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ifnb1P01575 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifnb1P01575 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnb1P01575 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms