Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odc1P00860 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Odc1P00860 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Odc1P00860 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odc1P00860 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odc1P00860 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odc1P00860 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Odc1P00860 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Odc1P00860 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Odc1P00860 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms