Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp8O89110 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Casp8O89110 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casp8O89110 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp8O89110 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Casp8O89110 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp8O89110 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Casp8O89110 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms