Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl20O89093 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl20O89093 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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