Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tcn2O88968 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tcn2O88968 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tcn2O88968 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms