Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba3O88888 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apba3O88888 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba3O88888 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba3O88888 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apba3O88888 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba3O88888 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apba3O88888 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apba3O88888 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms