Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hcn2O88703 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hcn2O88703 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms