Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
BlmO88700 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
BlmO88700 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
BlmO88700 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
BlmO88700 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
BlmO88700 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
BlmO88700 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
BlmO88700 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
BlmO88700 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BlmO88700 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
BlmO88700 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
BlmO88700 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BlmO88700 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
BlmO88700 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BlmO88700 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BlmO88700 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BlmO88700 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BlmO88700 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BlmO88700 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BlmO88700 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
BlmO88700 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BlmO88700 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BlmO88700 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BlmO88700 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BlmO88700 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BlmO88700 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
BlmO88700 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BlmO88700 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
BlmO88700 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BlmO88700 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BlmO88700 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BlmO88700 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
BlmO88700 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
BlmO88700 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
BlmO88700 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
BlmO88700 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BlmO88700 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
BlmO88700 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BlmO88700 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
BlmO88700 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
BlmO88700 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
BlmO88700 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
BlmO88700 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
BlmO88700 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BlmO88700 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
BlmO88700 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
BlmO88700 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BlmO88700 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BlmO88700 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BlmO88700 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BlmO88700 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BlmO88700 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BlmO88700 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
BlmO88700 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BlmO88700 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BlmO88700 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BlmO88700 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BlmO88700 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BlmO88700 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
BlmO88700 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BlmO88700 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BlmO88700 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BlmO88700 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BlmO88700 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BlmO88700 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BlmO88700 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BlmO88700 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BlmO88700 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BlmO88700 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
BlmO88700 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BlmO88700 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BlmO88700 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BlmO88700 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BlmO88700 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BlmO88700 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BlmO88700 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BlmO88700 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BlmO88700 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BlmO88700 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BlmO88700 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BlmO88700 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BlmO88700 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BlmO88700 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BlmO88700 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BlmO88700 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BlmO88700 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BlmO88700 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BlmO88700 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BlmO88700 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BlmO88700 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BlmO88700 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BlmO88700 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BlmO88700 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BlmO88700 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BlmO88700 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BlmO88700 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
BlmO88700 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BlmO88700 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BlmO88700 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BlmO88700 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 317.8 ms