Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sema3fO88632 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sema3fO88632 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms