Protein–RNA interactions for Protein: O88597

Becn1, Beclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn1O88597 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Becn1O88597 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Becn1O88597 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Becn1O88597 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Becn1O88597 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Becn1O88597 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Becn1O88597 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Becn1O88597 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Becn1O88597 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms