Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ComtO88587 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ComtO88587 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ComtO88587 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ComtO88587 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ComtO88587 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ComtO88587 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ComtO88587 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ComtO88587 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ComtO88587 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ComtO88587 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ComtO88587 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ComtO88587 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ComtO88587 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ComtO88587 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ComtO88587 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ComtO88587 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ComtO88587 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ComtO88587 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ComtO88587 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ComtO88587 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ComtO88587 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ComtO88587 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ComtO88587 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ComtO88587 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ComtO88587 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ComtO88587 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ComtO88587 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ComtO88587 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ComtO88587 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ComtO88587 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ComtO88587 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ComtO88587 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ComtO88587 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ComtO88587 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ComtO88587 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ComtO88587 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ComtO88587 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ComtO88587 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ComtO88587 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ComtO88587 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ComtO88587 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ComtO88587 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ComtO88587 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ComtO88587 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ComtO88587 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ComtO88587 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ComtO88587 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ComtO88587 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ComtO88587 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms