Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a20bO88575 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a20bO88575 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a20bO88575 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a20bO88575 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a20bO88575 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a20bO88575 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a20bO88575 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a20bO88575 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a20bO88575 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc6a20bO88575 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a20bO88575 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc6a20bO88575 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms