Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nid2O88322 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nid2O88322 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nid2O88322 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nid2O88322 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nid2O88322 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nid2O88322 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nid2O88322 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nid2O88322 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nid2O88322 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nid2O88322 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nid2O88322 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid2O88322 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nid2O88322 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nid2O88322 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nid2O88322 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms