Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cfdp1O88271 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cfdp1O88271 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms