Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec11aO88200 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec11aO88200 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec11aO88200 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms