Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx12O70493 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx12O70493 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snx12O70493 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snx12O70493 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Snx12O70493 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx12O70493 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx12O70493 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx12O70493 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx12O70493 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx12O70493 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx12O70493 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx12O70493 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx12O70493 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snx12O70493 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snx12O70493 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx12O70493 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx12O70493 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx12O70493 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx12O70493 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx12O70493 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx12O70493 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Snx12O70493 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx12O70493 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx12O70493 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx12O70493 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx12O70493 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx12O70493 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx12O70493 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx12O70493 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx12O70493 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms