Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtssO70370 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CtssO70370 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CtssO70370 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtssO70370 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CtssO70370 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtssO70370 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtssO70370 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CtssO70370 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtssO70370 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtssO70370 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtssO70370 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtssO70370 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtssO70370 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CtssO70370 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtssO70370 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtssO70370 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtssO70370 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtssO70370 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtssO70370 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtssO70370 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtssO70370 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CtssO70370 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtssO70370 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CtssO70370 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtssO70370 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CtssO70370 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CtssO70370 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtssO70370 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CtssO70370 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtssO70370 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CtssO70370 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CtssO70370 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CtssO70370 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtssO70370 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CtssO70370 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtssO70370 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtssO70370 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtssO70370 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtssO70370 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtssO70370 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CtssO70370 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CtssO70370 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CtssO70370 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtssO70370 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtssO70370 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtssO70370 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtssO70370 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtssO70370 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CtssO70370 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CtssO70370 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms