Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lnx1O70263 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lnx1O70263 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lnx1O70263 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms