Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtogO55225 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtogO55225 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtogO55225 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtogO55225 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtogO55225 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtogO55225 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtogO55225 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtogO55225 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OtogO55225 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OtogO55225 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtogO55225 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtogO55225 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtogO55225 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtogO55225 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtogO55225 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtogO55225 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtogO55225 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OtogO55225 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtogO55225 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtogO55225 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtogO55225 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtogO55225 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtogO55225 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtogO55225 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtogO55225 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtogO55225 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OtogO55225 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
OtogO55225 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtogO55225 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtogO55225 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtogO55225 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtogO55225 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtogO55225 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OtogO55225 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
OtogO55225 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OtogO55225 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
OtogO55225 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
OtogO55225 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
OtogO55225 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
OtogO55225 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtogO55225 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtogO55225 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtogO55225 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
OtogO55225 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtogO55225 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtogO55225 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtogO55225 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
OtogO55225 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OtogO55225 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OtogO55225 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtogO55225 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtogO55225 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtogO55225 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtogO55225 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtogO55225 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtogO55225 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OtogO55225 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OtogO55225 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms