Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tlx3O55144 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx3O55144 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms