Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl35aO55142 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rpl35aO55142 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rpl35aO55142 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rpl35aO55142 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rpl35aO55142 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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