Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn20O55082 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn20O55082 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn20O55082 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 286.3 ms