Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nck2O55033 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nck2O55033 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nck2O55033 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nck2O55033 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nck2O55033 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nck2O55033 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nck2O55033 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nck2O55033 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nck2O55033 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nck2O55033 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nck2O55033 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nck2O55033 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nck2O55033 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms