Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom1O54990 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom1O54990 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom1O54990 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prom1O54990 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prom1O54990 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prom1O54990 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prom1O54990 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prom1O54990 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prom1O54990 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prom1O54990 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prom1O54990 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prom1O54990 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prom1O54990 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prom1O54990 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms