Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarce1O54941 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarce1O54941 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarce1O54941 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms