Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rdh16O54909 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rdh16O54909 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms