Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf12O54907 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms