Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb3O54890 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb3O54890 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb3O54890 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb3O54890 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb3O54890 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itgb3O54890 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb3O54890 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb3O54890 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itgb3O54890 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itgb3O54890 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb3O54890 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb3O54890 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb3O54890 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb3O54890 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Itgb3O54890 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb3O54890 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb3O54890 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb3O54890 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb3O54890 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb3O54890 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb3O54890 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb3O54890 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb3O54890 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb3O54890 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms