Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxO54751 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxO54751 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxO54751 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxO54751 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxO54751 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxO54751 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxO54751 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CrxO54751 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxO54751 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxO54751 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CrxO54751 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CrxO54751 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CrxO54751 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CrxO54751 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CrxO54751 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CrxO54751 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CrxO54751 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CrxO54751 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CrxO54751 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CrxO54751 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CrxO54751 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CrxO54751 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CrxO54751 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CrxO54751 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CrxO54751 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CrxO54751 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CrxO54751 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CrxO54751 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CrxO54751 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CrxO54751 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CrxO54751 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CrxO54751 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxO54751 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxO54751 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxO54751 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxO54751 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxO54751 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxO54751 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CrxO54751 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CrxO54751 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CrxO54751 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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