Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccr6O54689 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccr6O54689 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms