Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per1O35973 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per1O35973 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Per1O35973 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Per1O35973 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per1O35973 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per1O35973 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per1O35973 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per1O35973 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Per1O35973 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per1O35973 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Per1O35973 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Per1O35973 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Per1O35973 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Per1O35973 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Per1O35973 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Per1O35973 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Per1O35973 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Per1O35973 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Per1O35973 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Per1O35973 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Per1O35973 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Per1O35973 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Per1O35973 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per1O35973 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Per1O35973 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per1O35973 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per1O35973 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per1O35973 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per1O35973 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per1O35973 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Per1O35973 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Per1O35973 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per1O35973 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per1O35973 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per1O35973 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per1O35973 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per1O35973 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per1O35973 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per1O35973 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per1O35973 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Per1O35973 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Per1O35973 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Per1O35973 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Per1O35973 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Per1O35973 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Per1O35973 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per1O35973 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per1O35973 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per1O35973 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per1O35973 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per1O35973 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per1O35973 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per1O35973 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per1O35973 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per1O35973 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Per1O35973 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Per1O35973 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Per1O35973 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Per1O35973 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Per1O35973 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Per1O35973 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Per1O35973 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Per1O35973 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms