Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CaluO35887 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CaluO35887 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CaluO35887 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CaluO35887 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CaluO35887 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CaluO35887 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CaluO35887 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CaluO35887 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaluO35887 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaluO35887 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CaluO35887 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaluO35887 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaluO35887 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaluO35887 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaluO35887 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaluO35887 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaluO35887 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CaluO35887 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CaluO35887 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CaluO35887 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CaluO35887 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CaluO35887 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CaluO35887 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CaluO35887 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CaluO35887 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CaluO35887 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CaluO35887 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CaluO35887 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaluO35887 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaluO35887 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaluO35887 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaluO35887 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CaluO35887 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CaluO35887 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CaluO35887 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CaluO35887 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CaluO35887 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CaluO35887 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CaluO35887 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CaluO35887 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CaluO35887 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CaluO35887 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CaluO35887 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaluO35887 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaluO35887 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaluO35887 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaluO35887 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaluO35887 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaluO35887 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaluO35887 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaluO35887 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CaluO35887 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CaluO35887 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CaluO35887 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CaluO35887 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CaluO35887 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CaluO35887 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms