Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klf12O35738 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Klf12O35738 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf12O35738 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms