Protein–RNA interactions for Protein: O35643

Ap1b1, AP-1 complex subunit beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1b1O35643 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap1b1O35643 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap1b1O35643 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms