Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sema6aO35464 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sema6aO35464 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms