Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Efnb3O35393 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efnb3O35393 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efnb3O35393 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms