Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kpna6O35345 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kpna6O35345 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kpna6O35345 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms