Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnfrsf11aO35305 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnfrsf11aO35305 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf11aO35305 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms