Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc18a3O35304 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc18a3O35304 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms