Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpsf2O35218 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpsf2O35218 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpsf2O35218 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cpsf2O35218 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cpsf2O35218 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms